مطالعه بیوانفورماتیکی تاثیرپلی فنول های استخراج شده از برگ درخت زیتون بردرمان تومور پستان سگ

کد مقاله : 1707-5VBS

نویسندگان

رضا نامی * دامپزشک هسته ای

چکیده مقاله

ترکیبات فنولی فراوانی همچون اولئوروپین در برگ درخت زیتون وجود دارند که اثرات درمانی آنها به عنوان آنتی اکسیدان های قوی بخوبی شناخته شده است. C- erbB2 یک گیرنده فاکتور رشد اپیدرمی می باشد که یک فاکتورمهم در تومورهای پستان سگ می باشد.هدف از ارائه ی این مقاله پژوهشی آنالیز فارماکودینامیک عصاره ی برگ درخت زیتون است که حاوی ترکیبات فنولی از قبیل اولئوروپین ،روتین،ورباسکوساید،لوتئولین -7-گلوکوزیدوهیدروکسی تیروزول بر روی پروتئین C- erbB2 برای جلوگیری از تومورزایی با تکنیک داکینگ است.درابتدا ساختار ترکیبات فنولی ذکرشده توسط نرم افزار chemsketch ترسیم شدوساختار کریستالوگرافی پروتئین C- erbB2 از پروئتین دیتابانک گرفته شد(pdb id 3pp0 resolution2.25 angstrom).پس از انرژی مینیمایز کردن با نرم افزار spdbv، فایل gridding parameterو فایل docking parameterتوسط نرم افزارautodocktools4 بدست امد و فایل های gpfو dpf نیزتوسط نرم افزار cygwinبدست امدند.بررسی فایل dlg بدست امده می تواند بهترینaffinity بین ترکیبات وپروتئین ها را نشان دهد.انالیز conformationalتوسط نرم افزار کایمرا انجام شد.براساس جدول های RMSD از فایل dlg، میزان انرژی اتصال ترکیبات ورباسکوساید،روتین،لوتئولین-7-گلوکوزیداز،اولئوروپین و هیدروکسی تیروزول به گیرنده را به ترتیب ازچپ به راست: -7.43kcal/mol,-10.28kcal/mol,-9.69kcal/mol,-5.54kcal/mol است .به علت اینکه روتین بیشترین انرژی اتصال را باگیرنده C- erbB2دارد،در نتیجه در میان 5 ترکیب بررسی شده در این مقاله برای ممانعت از C- erbB2مناسب تر است وهمچنین انالیز کانفورماسیون نشان داد که روتین جایگاه اتصال 3pp0از C- erbB2را پوشانده است .

کلیدواژه ها

سرطان پستان،روتین،فارماکودینامیک

وضعیت: پذیرفته شده