| آنالیز بیوانفورماتیکی خانواده ژنی UGT در گیاه آرابیدوپسیس |
| کد مقاله : 1370-5VBS |
| نویسندگان |
|
مرضیه اتحادپور * گروه مهندسی تولیدات گیاهی، مرکز آموزش عالی کشاورزی بردسیر، دانشگاه باهنر کرمان |
| چکیده مقاله |
| خانواده یوریدین دی فسفات گلیکوزیل ترانسفرازها (UGT) آنزیم‌هایی هستند که آگلیکون‌ها را به ترکیبات مرتبط با گلیکوزید تبدیل می‌کنند. آن‌ها با تنظیم سنتز هورمون‌های گیاهی و متابولیت‌های ثانویه نقش مهمی در مقاومت گیاهان در برابر تنش‌های غیرزنده دارند. خانواده ژنی UGT شامل 20 ژن در آرابیدوپسیس است که بر روی کروموزوم‌های مختلف واقع شده‌اند. به منظور آنالیز ژن‌های خانواده UGT ابتدا موقعیت ژن‌ها روی کروموزوم‌ها و ویژگی‌های آن‌ها مشخص گردید. سپس فعال بودن، پایداری و عدم پایداری، درصد چربی، درصد آبگریزی و نقطه ایزوالکتریک پروتئین‌های کد شده توسط این ژن‌ها تعیین گردید. آنالیز بیوانفورماتیکی شامل روابط فیلوژنتیک و انتولوژی ژن‌ها نیز انجام گرفت. براساس آنالیز فیلوژنتیک ژن‌های UGT به سه گروه تقسیم‌بندی شدند. انتولوژی ژن‌ها نشان داد که ژن‌های مورد بررسی در فرایندهای بیولوژیکی به بیوسنتز فلاونول، سیمت‌زدایی، پاسخ‌های دفاعی، متابولیسم اکسین، سیالیسیلیک اسید، سیگنال‌دهی ابسیزیک اسید و متابولیسم فنیل پروپانوئید تقسیم‌بندی می-شوند. همچنین این ژن‌ها در بخش عملکرد مولکولی فعالیت گلیکوزیل ترانسفراز و ترانسفرازی دارند. |
| کلیدواژه ها |
| آرابیدوپسیس، گلیکوزیل ترانسفراز، روابط فیلوژنتیک، متابولیت‌های ثانویه |
| وضعیت: پذیرفته شده |